Net als de Duitse Orde hadden de Nederlandse Johannieters, beide een geestelijke ridderorde, hun zetel in Utrecht. Eerst was die gevestigd bij de Catharijnepoort, maar na de bouw van Kasteel Vredenburg op die plek, verhuisden zij naar het Catharijneconvent aan de Lange Nieuwstraat. St. Catharina was hun patroonheilige. Net als de Duitse Orde probeerden de Johannieters in een officieel protestantse stad katholiek te blijven, maar dat lukte niet. De Johannieters gingen niet over tot het protestantisme. Dit betekende het einde van hun instelling. Hun kerk werd bestemd voor de gereformeerde eredienst en hun huis werd een stedelijk en universitair ziekenhuis.